企业购买农副产品且取得发票时，应当设置“原材料”科目以及“应交税费—应交增值税（进项税额）”科目核算；企业进行生产，领用农副产品时，可以进行加计扣除，应当设置“生产成本”科目以及“应交税费—应交增值税（农产品进项税额加计扣除）”科目核算。

加计扣除是指按照税法规定，主要是在实际发生数额的基础上可以再抵扣1%，作为计算应纳税所得额时的扣除数额的一种税收优惠措施。

具体的账务处理如下，

1、企业购买农副产品且取得对应发票时：

借：原材料，

应交税费—应交增值税（进项税额），

贷：银行存款。

2、企业进行生产，领副产品时：

借：生产成本。

应交税费—应交增值税（农产品进项税额加计扣除），

贷：原材料。