基金会计定义为：“指政府会计（包括政府财政部门会计和政府行政部门会计）及公立非营利组织会计（国有事业单位会计）以基金为基础，按照基金种类进行会计核算与报告的会计体制或模式”。

一般而言，不同的基金类型具有不同的会计等式。政府基金会计等式为：流动资产－流动负债=基金余额；权益基金会计等式为：流动资产+非流动资产=流动负债+长期负债+缴入资本+保留余额。权益基金会计与政府基金会计不同的是，要计量和确定净收益、财务状况和现金流量。