小规模纳税人增值税申请流程：

1、进入电子申报系统，打开申报与缴纳功能，找到小规模增值税报表，

2、进入报表，系统会指引填写不含税的收入，按不同的税率填写相关的不含税收入，正确无误后点确定。

3、进入主表，如果季度不含税销售额不超过45万，直接填写主表的第十行，个体户需要填写十一行。如果有代开的增值税专票，要填写到主表的前三行的相应栏次中。如果季度不含税销售额超过45万，按前三栏的相应内容进行填写。

4、填写完毕，看是否税额正确，如果开有1%的税费的，要填写减免明细表，把减征的2%税额填写进行，这样就可以达到减税的目的。

5、如果是免税销售额，可以直接填写第十二行。

6、申报完毕无误后，直接保存。

7、到申报功能下点申报，当申报状态是申报成功后，就可以进行缴费等流程。