小规模纳税人取得税务机关代开的增值税专用发票是不可以抵扣。

由于小规模纳税人已经执行了征收率的低税率，不具备一般纳税人性质，所以不能再进行抵扣专票了，即使取得也不能抵扣，只能当普通发票来使用，同时，我们不建议小规模纳税人索取专票，具体原因分析如下：

虽然小规模纳税人不可以抵扣增值税专用的发票的进项税，但是在整个税控盘的开票系统中会因为某一张增值税专用发票没有被抵扣进项税而产生系统滞留。这样一来税务部门就会查找这张发票最终流向，这无形中就加大了接收这张发票的小规模纳税的查账风险。

综上所述，我们建议小规模纳税人尽量不要接收或者开具增值税专用发票，以免给自己增加不必要的税务麻烦。